Галерея
10226 10775 10933 11397 11485 11822 12520 12693
Интересные записи
Топовое
Случайное

Геном вирофага

Геном вирофагаГеном вирофага имеет размер 18343 п. н. (21 ORF) и представлен кольцевой сЬДНК. Плотность кодирования высока, и гены частично перекрываются; молярный % АТ-пар идентичен таковому у мамавируса. Более половины генов (13 из 21) не обнаруживают гомолога в базах данных. У одного из них, гена интегразы, имеются высокогомологичные ортологи в геномах вирусов архей. Три гена идентичны ортологам в геномах мамавирусов и мимивирусов; это позволяет предположить, что при сборке на одних и тех же вирусных фабриках между ними происходит рекомбинация. Таким образом, вирус Sputnik служит примером вируса-химеры. Его систематическое положение пока еще не ясно, однако предполагается, что он входит в группу NCLDV-подобных вирусов из морских и пресных водоемов. В пользу этого говорят результаты метагеномного анализа. На основе последовательностей ДНК, выделенной из проб воды одного из антарктических озер, удалось реконструировать геном «виртуального» вируса OLV (сокр. от англ. Organic Lake virophage); его гены оказались сходными с генами вируса Sputnik. Удалось также реконструировать полноразмерный геном ранее неизвестного вида фиковирусов — OLPV (сокр. от англ. Organic Lake phytovirus), который скорее всего инфицирует празинофитные водоросли. Судя по наличию ортологов у вирусов OLV и OLPV, они в ходе эволюции могли обмениваться между собой генетическим материалом. Присутствие вирофагов несомненно является фактором, ограничивающим вирусные инфекции микроскопических водорослей в бедных органикой полярных водоемах, что стабилизирует короткие пищевые цепи этих экосистем, косвенно повышая их продуктивность.

Mavirus. С вирусом CroV, инфицирующим жгутиконосца С. roenbergensis, ассоциирован вирофаг Mavirus (от названия класса транспозонов Maverick, которые сходны с геномом этого вируса и кодируют практически идентичную интегразу; в свою очередь, название «Maverick», ангп. — неортодоксальный, дано этим транспозонам из-за их уникальной способности кодировать ДНК-полимеразу Pol В и уникального механизма репликации).

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *