Галерея
10226 10775 10933 11397 11485 11822 12520 12693
Интересные записи
Топовое
Случайное

R/M-системы типа II

R/M-системы типа IIОни самые распространенные; вместе с изошизомерами их насчитывается до 3000. Напомним, что Изошизомерами (англ, isoschizomer; от греч. isos — равный, schizo — раскалывать и meros — часть) называются рестриктазы у разных объектов, которые разрезают в одном и том же месте одинаковую последовательность (например, для рестриктаз BamHl и Рае 1771 это последовательность GfGATCC). Они проще других, поскольку два фермента по отдельности катализируют рестриктазную и метилазную реакции.

Главный признак R/M-системы типа II — это то, что рестриктаза наносит разрез в пределах сайта узнавания или близко к нему; кроме того, для нуклеолитической реакции не требуется гидролиз АТФ. Рестриктаза представляет собой гомодимер субъединиц молекулярной массой ~30 кДа. Сайт узнавания обычно палиндромный, со сплошной структурой, например GAATTC, или с прерывистой структурой, например GANTC или CCAN9TGG (где N — один из четырех канонических нуклеотидов). Встречаются уникальные сайты узнавания, например GTCGAC, и вырожденные сайты, например GTYRAC (где Y — С или Т, a R — А или G). Рестриктазы типа II наносят разрез внутри комплементарных последовательностей сайта узнавания; классическим примером служит рестриктаза Escherichia coli R Eco RI: Поскольку сайт рестрикции представляет собой палиндром, в ds-ДНК делаются симметричные разрезы с образованием коротких одноцепочных липких концов (в приведенном примере это ААТТ). Такое замечательное свойство продуктов рестрикции широко используется в молекулярной биологии при конструировании гибридных ДНК.

R/M-систем подтипа IIS насчитывается на порядок меньше, чем R/M-систем типа II. Они распознают асимметричную сплошную последовательность длиной 4-7 п. н. и наносят разрез по одну сторону от сайта узнавания, обычно на фиксированном расстоянии 1-20 п. н. от него. Примером служит рестриктаза Flavobacterium okeanokoites Fokl: Иными словами, рестриктазы подтипа IIS содержат домен сродства к сайту узнавания, и домен, отвечающий за распознавание сайта рестрикции (в этом отношении они сходны с рестриктазами класса III; см. ниже).

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *