Ранние этапы инфекции

Ранние этапы инфекции растянуты во времени; первые вирусные мРНК появляются только через 12 ч после первичного инфицирования. Белок Е2 может служить как активатором, так и репрессором «раннего» промотора р97. Когда его мало (начало инфекции), он присоединяется только к сайтам 3 и 4 области LCR и служит активатором; когда его много, он дополнительно связывается с сайтами 1 и 2. Транскрипция поздних генов L1 и L2 осуществляется с «позднего» промотора р67; она сопровождается сменой раннего сайта полиаденилирования (англ, polyad — enylation early site, РАЕ) на поздний (англ, polyadenylation late site, PAL).

Репликация. Инициаторами репликации геномной ДНК служат белки Е1 и Е2. Белок Е2 является ДНК-связывающим; он распознает палиндромные последовательности AACCG(N)4CGGTT, расположенные в области LCR. Белок Е1 также обладает ДНК-связывающими свойствами, но они слабее выражены.

В начале инфекции число копий белка Е1 невелико, и с сайтом Ori связывается комплекс белков Е1/Е2, который локально расплетает dsflHK. Затем, по мере удаления белка Е2, к области LCR присоединяются новые молекулы белка Е1. Последние образуют двойное гексамерное кольцо (которое имитирует структуры, образующиеся в сайтах Ori на хозяйских хромосомах); в эту же область привлекаются компоненты клеточного репликазного комплекса — белок А и праймаза. В делящихся клетках базального слоя эпителия в конце S-периода число копий вирусного генома достигает 50-200. Вирусная ДНК при посредстве белка Е2 и специализированных клеточных белков связывается с микротрубочками веретена, что обеспечивает эквивалентное распределение копий вирусного генома между дочерними клетками. Некоторые папилломавирусы могут подолгу реплицироваться в форме плазмиды; в частности, в стволовых кератиноцитах они сохраняются в течение нескольких лет. На поздних стадиях размножения используется белок Е5. Взаимодействуя с протонной АТФазой, он тормозит закисление полости эндосомы и нарушает процессы рециклизации поверхностных рецепторов. Тем самым обеспечивается благоприятная среда для репродукции вируса, а клетки верхних слоев эпителия обогащаются рецептором EGF (сокр. англ, epidermal growth factor).