Род Coccolithovirus
Хозяином представителей рода Coccolithovirus служит широко распространенная одноклеточная водоросль Emiliania huxleyi (ранее известная как Coccolithus huxleyi). Это наиболее многочисленный из водорослей-кокколитофоров вид, один из доминирующих в фитопланктоне Мирового океана, и один из важнейших первичных продуцентов. Кальцит, который они накапливают во время цветения и который после их отмирания оседает на дно, — среди главных источников неорганического углерода в морской воде, а также важнейших палеонтологических документов. Кроме того, при гибели Е. huxleyi образуется диметилсульфоксид. Таким образом, кокколитофоровые водоросли — важное звено круговорота углерода и серы.
Род Phaeovirus. Представители рода Phaeovirus заражают бурых водорослей (единственные многоклеточные хозяева фиковирусов). Род Prasinovirus. Фитовирусы рода Prasinovirus, инфицирующие празинофитную водоросль Micromonas pusilla, могут ежедневно лизировать до 25% клеток ее популяции, однако высокий темп деления клеток хозяина позволяет симбиотической ассоциации сохранять относительное равновесие по сравнению с неустойчивой системой Emiliania-Coccolithovirus. Род Prymnesiovirm. Хозяевами вирусов рода Prymnesiovirus выступают гапто — фитные водоросли родов Chrysochromulina и Phaeocystis, широко распространенные в морях и океанах. Они относительно редко вызывают цветение водоемов; когда же это происходит, Chrysochromulina sp. образует экзотоксин, вызывающий массовую гибель рыб. Более частое «цветение» Phaeocystis sp. обычно заканчивается внезапной гибелью популяции водоросли, и тогда в воде появляется множество органических субстратов, что вызывает вспышку развития гетеротрофных бактерий. В свою очередь, это приводит к дефициту кислорода в экосистеме, а также нарушает природный круговорот углерода и серы. Массовая гибель гаптофитных водорослей напрямую связана с примнезиовирусной инфекцией.
Род Raphidovirus. Обычными представителями морского фитопланктона в прибрежных районах являются рафидофитные водоросли. Их массовое размножение вызывает феномен «красного» прилива (англ, red tide), когда вода приобретает красноватый цвет, и в ней накапливаются токсины, убивающие рыб. Один из видов рафидофитов, Heterosigma akashiwo, служит хозяином для вирусов рода Raphidovirus.