Сайзспецифичное инкапсидирование

При Сайзспецифичном инкапсидировании (англ, size — размер) внутреннее пространство капсида не только предоставляется для размещения копии генома (синтезируемой непосредственно при размножении вируса или образующейся в результате расщепления Конкатемера (англ, concatemer), т. е. цепочки из нескольких молекул геномной нуклеиновой кислоты), но и обладает некоторой объемной избыточностью. Благодаря этому вирионы некоторых вирусов, например РНК-содержащих вирусов растений, приобретают дополнительные сегменты генома, в частности, сателлитные РНК (см. главу 5). При Сайтспецифичном инкапсидировании (англ, site — участок) один или несколько участков нуклеотидной последовательности вирусного генома обладают сродством к структурным белкам капсида, т. е. нуклеиновая кислота включается в состав вириона неслучайным образом. Например, капсидный белок РНК-содержащего фага MS2 распознает последовательность протяженностью 19 нуклеотидов, содержащую старт-кодон гена репликазы, что обеспечивает двойной контроль инкапсидирования и трансляции. Сайз — и сайтепецифичное инкапсидирование сосуществуют у некоторых трансдуцирующих бактериофагов (в частности, у фага лямбда). Такие бактериофаги широко используются в качестве генетических векторов, поскольку практически любая последовательность в составе конструкции, содержащей «упаковочный» Рас-сАйт, может инкапсидироваться, если только этому не препятствует ее слишком большой размер. Сайз — и сайтспецифичное инкапсидирование сочетаются и при общей трансдук — ции. Благодаря участкам гомологии с упаковочными ряс-сайтами, а также из-за избыточного внутрикапсидного пространства взамен нуклеиновой кислоты бактериофага в капсид может включиться больший по размеру случайный фрагмент хозяйской ДНК. Критический этап инкапсидирования — проникновение нуклеиновой кислоты в капсид — наименее изучен. В частности, не известен источник энергии, используемый при этом виде транспорта; возможно, что его природа не одинакова у разных вирусов.