Малые РНК

Малые РНК, которые могут быть как эндогенного, так и экзогенного происхождения, подразделяются на две группы — Малые интерферирующие РНК, или siPHK (англ, small interfering RNA, siRNA), и Микро-РНК, или miPHK (англ. microRNA, miR — NA). Они различаются способом образования и спецификой механизма интерференции, хотя используются одним и тем же комплексом RISC. Посттранскрипционный сайленсинг (PTGS); малые интерферирующие РНК. Малые интерферирующие РНК являются продуктом процессинга длинных, полностью спаренных молекул dsPHK (рис. 19). По своему происхождению это: 1) репликативные интермедиаты РНК-содержащих вирусов; 2) продукты двунаправленной транскрипции повторяющихся последовательностей хромосомной ДНК или повторяющихся последовательностей транспозонов; 3) продукты РНК-зависимых РНК-полимераз, которые синтезируют комплементарные нити клеточных РНК; 4) продукты комплементарного объединения резидентных транскриптов и трансгенных транскриптов. После нарезания дайсер-ферментом дуплексы siPHK метилируются по 2-нуклеотидным «навесам» с помощью метилтрансферазы HEN 1 (сокр. англ, hua enhancer; Мутации по гену hua, что по-китайски значит «цветок», замедляют цветение араби — допсиса). Смысл данной модификации заключается в том, чтобы предохранить малые РНК от полиуридилирования и разрушения нуклеазами. Затем ds-siPHK расплетается на одиночные нити — «активную» (англ, guide strand) и «пассивную» (англ, passenger strand); у первой из них 5′-конец слабее спарен с комплементарной нитью и менее стабилен. «Пассивная» нить разрушается, а «активная» нить связывается с ферментативным компонентом комплекса RISC — цитоплазматическим белком AG01 (сокр. англ, argonaute — аргонавт; Название происходит от фенотипа «argonaute» мутантов Arabidopsis thaliana, которые по форме напоминают осьминога Argonauta sp.). С помощью еще не выясненного механизма комплекс RISC доставляет «активную» нить к комплементарной ей последовательности мРНК. После образования дуплекса белок AG01, обладающий слайсерной активностью (от англ, slice — нарезать ломтиками), осуществляет эндонуклеазное расщепление мРНК. В альтернативном варианте siPHK доставляется к последовательности-мишени, чтобы выступить в качестве негативного регулятора (репрессора) трансляции.