Определение серотипа бактерии

Определение серотипа бактерии по способности стандартного бактериофага лизировать ее культуру называется Фаготипированием; этот метод используется для идентификации патогенных бактерий, в частности сальмонелл.

О-антиген служит в первую очередь рецептором Т-четных фагов. Следует учесть, что у сложноустроенных вирионов этап адсорбции состоит из нескольких обратимых или необратимых стадий. Отдельные части вириона (короткие и длинные фибриллы базальной пластинки, белки хвостового отростка и др.) последовательно взаимодействуют с разными рецепторами или разными доменами одной и той же рецепторной молекулы.

При связывании бактериофага с О-цепью она обычно разрушается в результате гидролазной активности вирусных белков, что позволяет вириону вступить в прямой контакт с ОМ. С кор-олигосахаридом преимущественно связываются фаги S13, 6SR, ТЗ, Т7 и фХ174. В лабораторных условиях они предпочтительно инфицируют лишенные О-специфичной боковой цепи R-мутанты (сокр. англ, rough — шероховатый; У R-мутантов колонии имеют шероховатую поверхность). Эти бактериофаги развиваются на более широком круге хозяев и способны поражать близкородственных бактерий кишечной группы, в частности Escherichia sp., Salmonella sp. и Shigella sp. Как показал анализ бактериальных мутантов с заменами или удалением моносахаридов в дистальном домене кор-олигосахарида, для эффективной адсорбции бактериофага гораздо важнее общая пространственная конфигурация рецептора, чем последовательность расположения его мономеров.

Белки наружной мембраны. Помимо LPS, рецепторами бактериофагов могут быть белки, входящие в состав ОМ. В частности, структурный белок ОтрА служит рецептором для трансдуцирующих фагов КЗ, 0x2 и Tull*.

Порины «общего назначения» фильтруют субстраты по размеру, хотя предпочтительно это нейтральные молекулы и катионы. Они служат рецепторами для фагов SSI, ТР2, Tula и Tulb, а также для фага Т4 на стадии необратимой адсорбции. «Специализированные» порины, которые содержат стереоспецифичные сайты связывания субстратов, транспортируют молекулы определенных типов, например моно — и дисахариды, а также нуклеозиды и жирные кислоты. Это индуцибельные белки, и их количество изменяется в зависимости от внешних условий. Соответственно на эффективность адсорбции влияет качественный состав транспортируемых субстратов.