Галерея
10226 10775 10933 11397 11485 11822 12520 12693
Интересные записи
Топовое
Случайное

Клетка-хозяин распознает чужеродный генетический элемент

Клетка-хозяин распознает чужеродный генетический элементКак клетка-хозяин распознает чужеродный генетический элемент на основе его сходства со спейсером? Каким образом этот спейсер был ею приобретен? Каков молекулярный механизм антивирусного иммунитета, основанного на системе CRISPR/cos? Механизм действия системы CRISPR/co5. По современным представлениям, клетка-хозяин «крадет» протоспейсер (англ, protospacer) из геномной ДНК бактериофага и в качестве спейсера включает ее в локус CRISPR. При этом последовательность протоспейсера выбирается из генома бактериофага не случайно, а путем узнавания «мотива, примыкающего к протоспейсеру» (англ, protospacer adjacent motif, РАМ), расположенного в downstream-положении от протоспейсера и имеющего консенсусную структуру NNAGAAW (W обозначает А или T(U), N — одно из четырех нуклеотидных оснований). Неизвестно, каким образом информация передается от бактериофага системе CRISPR/cns, как узнается РАМ, как «крадется» протоспейсер, и как он интегрируется. Имеются отдельные намеки на то, что роль нуклеазы/геликазы/интегразы играет продукт гена Casl. В фазе процессинга локус CRISPR транскрибируется с образованием молекул CRISPR-PHK (англ. crRNA), которые выполняют роль прокариотных сайленсинг — РНК (англ, prokaryotic silencing RNA, psiRNA) (см. раздел 1.7.3). Транскрипция начинается на участке «лидерной» последовательности, действующей как промотор, или вблизи нее, в результате чего образуется предшественник пре-сайленсинг-РНК, равный по длине полноразмерному локусу CRISPR. Затем первичный транскрипт подвергается эндонуклеазному процессингу с образованием фрагментов, длина которых соответствует двум повторам с промежуточным спейсером. Процессинг осуществляется комплексом Cascade (сокр. англ. CRISPR-associated complex for antiviral defence), состоящим из генов Csel, cse2, Cse4t cas5e и Cse3. На окончательном этапе процессинга образуется зрелая молекула сайленсинг-РНК (crRNA/psiRNA), которая состоит из 8-нуклеотидной концевой последовательности (англ, tag — конец), оставшейся от реплики повтора, и реплики спейсера.