Рудивирусы SIRV1 и SIRV2

Рудивирусы SIRV1 и SIRV2 были выделены в 1999 г. в Исландии группой Вольфрама Циллига. По частоте встречаемости и степени изученности они занимают второе место среди вирусов Crenarchaeota (после Fuselloviridae). Безоболочные вири — оны этих вирусов имеют форму жесткой палочки (23×600-900 нм) и внешне напоминают ssPHK-содержащих вирусов сосудистых растений, в частности тобамовиру — сов. Однако, в отличие от последних, на концах жесткого цилиндрического капсида рудивируса имеются «пробки» (50 нм) с тремя нитями, служащими для адсорбции; тем не менее образование вирионов вируса SIRV1 не индуцируется УФ-облучением или обработкой митомицином С, и он не вызывает лизиса клеток хозяина. Вирусы SIRV1 и SIRV2 содержат линейную dsflHK (35-36 тыс. п. н.) с длинными терминальными инвертированными повторами (англ, inverted terminal repeat, ITR) и ковалентно замкнутыми концевыми шпильками. Такая структура (напоминающая теломеры линейных хромосом у эукариотов) обеспечивает репликацию путем «автопраймиро — вания» — введения однонитевых разрезов внутри ITR, образования интермедиатов типа «голова к голове» и «хвост к хвосту» с последующим превращением геномных конкатемеров в мономеры с помощью кодируемой вирусом резольвазы хиазмы Холлидея. Согласно результатам молекулярного секвенирования геномы вирусов SIRV1 и SIRV2 содержат 45 и 54 ORF (55-1070 а. о.), соответственно. Из них 21 ORF проявляет отдаленное сходство с генами ДНК-содержащих вирусов ядерных организмов; в частности, восемь ORF сходны с генами Amsacta mooreii pox virus (сем. Poxviridae), Семь ORF — с генами African swine fever virus (сем. Asfarviridae) и Paramecium bursaria — Chlorella virus PBCV-1 (сем. Phycodnaviridae). Рудивирус ARV1 был выделен в 2005 г. группой Давида Прангишвили из горячего источника в окрестностях г. Поццуоли (Италия). В составе жесткого нуклеокапсида, имеющего форму палочки (610×22 нм) с тремя длинными хвостовыми нитями на каждом конце, выявлены два белка — гликозилированный капсомерный белок (14,4 кДа) и минорный белок (24 кДа) неизвестной функции. Линейная dsflHK (24,7 тыс. п. н.) содержит концевые инвертированные повторы длиной 1365 н. В геноме этого вируса идентифицированы гены структурных и ДНК-связывающих белков, а также гены резольвазы и тимидилатсинтазы. Несмотря на морфологическое сходство с вирусами группы SIRV, вирус ARV1 существенно отличается от них в генетическом плане.