Максимальный размер генома у вирусов NCLDV

Максимальный размер генома у вирусов NCLDV составляет 1200 тыс. п. н. Для сравнения — у бактерий самый маленький геном, 145 тыс. п. н., имеет облигатный симбионт цикадок «Candidatus Hodgkinia cicadicola». Число кодируемых белков у них приближается к 1000 (в то время как протеом облигатной патогенной бактерии Mycoplasma genitalium насчитывает 470 белков). Группа NCLDV служит редким примером монофилетичности у вирусов; несмотря на значительную внутреннюю дивергенцию (ее представители различаются по многим признакам и инфицируют взаимно удаленных хозяев), наличие высококонсервативных генов позволяет реконструировать их эволюцию. Установлено, что геном общего предка вирусов NCLDV содержал 47 «обязательных» генов, которые отвечали за основополагающие функции: репликацию ДНК, транскрипцию и сборку вирионов. Дальнейшая судьба данных генов в разных эволюционных линиях (подгруппах) оказалась различной. Все вирусы группы NCLDV имеют 9 кор-генов (группа I); еще 22 гена (группа II) обнаружены у представителей, по крайней мере, трех семейств. Анализ инфраструктуры этих генов позволяет проследить эволюцию данной группы вирусов и оценить степень их взаимного эволюционного родства. Как показывает филогенетический анализ, отдельные подгруппы в группе NCLDV дивергировали раньше, чем родоначальники основных эволюционных ветвей (царств) ядерных организмов, т. е. 2-3 млрд лет назад. Интересно, что у всех NCLDV кор-гены расположены в центральном участке геномной ДНК, а гены, приобретенные путем горизонтального переноса, — преимущественно на флангах. Точки зрения на эволюцию этих вирусов противоречивы. Существуют альтернативные, в равной степени обоснованные гипотезы: 1) дивергентная потеря генов из состава исходно большого предкового вирусного (или даже клеточного) генома,

2) приобретение исходно небольшим предковым геномом все новых и новых генов от разных доноров путем горизонтального переноса. С эволюционной точки зрения очень важно, что отдельные гены вирусов NCLDV обладают низким сходством с их ортологами у эукариота-хозяина, но зато хорошо группируются друг с другом. Следовательно, роль горизонтального переноса генов от хозяина относительно невелика, что противоречит сценарию эволюции этих вирусов путем приобретения эукариотных генов.