Размер генома аденовирусов

Размер генома аденовирусов варьирует в пределах от 26 тыс. п. н. (у представителей рода Siadenovirus) до 46 тыс. п. н. (у представителей рода Aviad — enovirus). На концах геномной ДНК находятся инвертированные повторы (англ, inverted terminal repeat, ITR), при спаривании которых образуется большая шпилька (англ, pan-handle — сковорода с ручкой). На 5′-конце следом за ITR расположена последовательность V (сигнал инкапсидирования), необходимая для упаковки ДНК. Концы молекулы геномной ДНК ковалентно связаны с молекулами «терминального» белка ТР (сокр. англ, terminal protein), необходимого для инициации репликации.

Геном аденовирусов можно условно подразделить на четыре функциональных блока: гены белков, обеспечивающих репликацию генома вируса, т. е. ген ДНК — полимеразы, ген предшественника белка ТР, белка рТР (сокр. англ, pre-terminal protein) и ген ДНК-связывающего белка DBP (сокр. англ. DNA-binding protein);

Гены малых вирус-ассоциированных РНК (англ, virus-associated RNA, VA-RNA), которые не транслируются и выполняют регуляторные функции. В соответствии с очередностью их экспрессии гены аденовирусов условно подразделяются на ранние (англ, early, Е) и поздние (англ, late, L). Геномные участки Е1 и ЕЗ кодируют белки, регулирующие цикл репликации и способствующие подавлению иммунного ответа хозяина. Поздние гены кодируют в основном белки капсида. Вирусные мРНК синтезируются клеточной PH К-полимеразой II. Большинство генов транскрибируется в направлении 543′, в то время как гены, необходимые для репликации ДНК (Pol, рТР и DBP), считываются в направлении 345′. Обращает на себя внимание высокая плотность кодирования: при наличии всего 10 промоторов геном аденовирусов человека кодирует свыше 50 белков. Разнообразие мРНК достигается за счет посттранскрипционного процессинга (сплайсинга). Следует отметить, что именно аденовирусы послужили в свое время моделью для изучения этого явления. Как уже отмечалось, геном аденовирусов кодирует не только белки, но и малые вирус-ассоциированные РНК (VA-RNA), которые синтезируются с помощью клеточной РНК-полимеразы III. Аденовирусы типа-2 и типа-5 кодируют две вирус-ассоциированные РНК — VA-I и VA-II, которые экспортируются в цитоплазму и накапливаются в большом количестве, особенно в конце цикла размножения.