Вирусная ДНК

Вирусная ДНК, особенно у бактериофагов, часто содержит минорные азотистые основания. Примером служит группа гидроксиметилцитозина, например 5-гидро — ксиметилцитозин (в случае Т-четных бактериофагов Е. coli). Кроме того, с целью защиты от рестриктаз хозяина обычные пуриновые и пиримидиновые основания модифицируются посредством ферментативного метилирования в положении 2 и положении 5, соответственно.

ДНК чаще всего бывает двунитевой (ДвДНК), хотя встречаются вирусы с одно — нитевой ДНК (эвДНК; в качестве примера можно назвать некоторых бактериофагов). РНК-вирусы, напротив, чаще всего содержат ssPHK; вирусы с dsPHK, в частности реовирусы, более редки. По контурной конфигурации геномная нуклеиновая кислота может быть линейной (большинство скДНК-вирусов) или кольцевой (сем. Circoviridae).

Геномная нуклеиновая кислота вируса обычно представлена единственной молекулой (сем. Picornaviridae). Такой геном называется Монолитным. В более редких случаях несколько неидентичных молекул РНК, своего рода хромосомы, заключены в общий капсид; примерами служат представители семейств Orthomyxoviridae и Reo — viridae. Геномы таких вирусов называются Сегментированными (см. ниже). Еще реже, в частности у некоторых представителей семейства Virgaviridae, неидентичные молекулы геномной нуклеиновой кислоты упакованы в разные капсиды; это так называемые Партитные геномы (см. ниже). Для генетической полноценности вирусу необходимо и достаточно обладать полной копией генома. Однако сборка вириона, которая обеспечивает инкапсидирование геномной нуклеиновой кислоты, не всегда приводит к такому результату. Иногда в капсид попадает сразу несколько копий генома (примерами служат бактериофаг лямбда и парамиксовирусы), иногда, напротив, в капсиде оказывается неполная копия генома. Наконец, из-за ненадежного или дефектного механизма сборки вируса могут образовываться абортивные вирионы, представляющие собой не заполненные геномной нуклеиновой кислотой, т. е. «пустые» капсиды.