Число серотипов вируса

От числа серотипов вируса зависит возможность создать вакцину против соответствующего заболевания. Например, у вируса кори известен только один серотип, и поэтому вакцинирование любым аттенуированным (ослабленным) штаммом обеспечивает защиту от заболевания. В свою очередь, в вакцину против вируса полиомиелита необходимо включать ослабленные штаммы сразу трех серотипов. Наконец, создать вакцину против риновируса вообще нереально из-за слишком большого количества его серотипов.

Подразделение серотипов на подтипы и антигенные варианты осуществляется в иммунологических реакциях с моноклональными антителами (МКАТ). Их искусственно получают путем гибридизации В-лимфоцитов иммунизированных животных с клетками культуры миеломы. МКАТ синтезируются специально подобранными клонами клеток гибридомы. Их главное отличие от сывороточных антител заключается в том, что у определенного клона они направлены к одним и тем же эпитопам (антигендетерминирующим участкам) вирусных белков, в то время как сывороточные антитела могут быть направлены не только к разным эпитопам, но и к разным белкам. Проще говоря, все МКАТ определенной группы одинаковы, в то время как сыворотка всегда содержит широкий спектр антител. Структура белков вируса определяется его генотипом. В современных условиях, при широком использовании молекулярного секвенирования, проще определить генотип вируса, чем его серотип, поскольку иммунные сыворотки не всегда доступны. Однако для практических целей, например для вакцинации, нужно в первую очередь знать серотип вируса. Во многих случаях (хотя далеко не всегда) серотип можно косвенно определить, сравнивая реконструированную аминокислотную последовательность с таковыми у белков вируса известного серотипа, которые представлены в GenBank. Попытка найти полное соответствие между генотипами и серотипами вируса может не удасться даже в том случае, когда сравниваются последовательности так называемых «нейтрализующих» эпитопов вирусного белка. Причина неудачи состоит в том, что по аминокислотной последовательности трудно предсказать третичную и четвертичную структуру белка, которая определяет серотип. В тех случаях, когда в литературе употребляется термин «тип» (англ, type) или «подтип» (англ, sub — type), обычно имеется в виду именно серотип вируса.