Галерея
10226 10775 10933 11397 11485 11822 12520 12693
Интересные записи
Топовое
Случайное

Механизм белкового праймирования

Механизм белкового праймированияМеханизм белкового праймирования изучен на примере фага ф29 (20 тыс. п. н.). Для бактериофагов, использующих его, характерно наличие коротких инвертированных терминальных повторов; у фага ф29 это 3′-ТТТСАТ-5 По аналогии с РНК — праймером, содержащим свободную З’-ОН группу, у белка Tpg такие группы имеются в остатках Ser, Туг и Тге. При инициации репликации образуется гетеродимер ДНК-полимераза/Tpg, что способствует образованию фосфодиэфирной связи между ОН-группой остатка Ser-232 в белке Tpg и 5′-бАМФ. Связывание нуклеотида в присутствии дополнительных ранних белков делает сайт Ori доступным для этого гетеродимера. Праймирование с помощью белка Tpg продолжается до момента встраивания 10-го нуклеотида, после чего гетеродимер диссоциирует, и происходит переход к РНК-праймированию. Репликация начинается на обеих комплементарных нитях, однако с разных концов и не одновременно; частично реплицированные матрицы разделяются до встречи разнонаправленно движущихся полимеразных комплексов. Поэтому в данном случае не требуется участие геликазы, но зато необходим еще один продукт генов раннего оперона — SSB-белок, который защищает одноцепочный участок репликативного интермедиата. Считается, что нити разделяет вирусная ДНК — полимераза (ее N-концевой-домен обладает экзонуклеазной активностью).

Белковое праймирование не уникально для бактериофагов; этот консервативный механизм описан у аденовирусов, плазмид (например, S1 и Kalilo), а также у бактерий рода Streptomyces. У бактериофагов, содержащих линейную бзДНК, имеются геномные модификации, которые способствуют формированию репликативных интермедиатов. Это: Концевая избыточность (англ, terminal redundancy), которая встречается у Т-четных фагов. В данном случае на обоих концах линейной ДНК находятся одинаковые последовательности, которые образуются при headful-упаковке (см. раздел 2.3.4), когда от конкатемера отрезается фрагмент большего размера, чем копия генома. Если геном можно схематически изобразить как ABCDEF, то геном с концевой избыточностью выглядит как ABCDEFAB;

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *