Понятие штамм

Понятие «штамм» (англ, strain) используется по отношению к изолятам вируса, полученным в лаборатории из клинического материала путем пассирования на лабораторных животных или на клеточных культурах; в коллекции может храниться несколько штаммов одного и того же серотипа или генотипа. Одной из важнейших характеристик вирусного штамма служит история выделения и пассирования, которая обязательно должна быть отражена в его паспорте. Нередко случается, что нуклеотидные последовательности первичного изолята и полученного на его основе лабораторного штамма существенно различаются, что обусловлено адаптацией вируса к специфическим условиям культивирования. Особые требования предъявляют к штаммам, которые используются при производстве вакцин и тест-систем — в первую очередь это генетическая стабильность и высокая продуктивность. В современных условиях необходимой кондиции вирусных штаммов удается добиться с помощью методов генной инженерии. При работе с медицинской литературой следует помнить, что кроме научной классификации вирусов их для удобства часто объединяют в группы по вызываемым заболеваниям: вирусы гепатитов (ВГ), вирусы энцефалитов (ВЭ), вирусы острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ), вирусы гастроэнтеритов (ВГЭ) и т. д. В таких группах вирусы объединены вне зависимости от их генетического материала. В качестве примера можно привести гепатовирусов: вируса гепатита А (Hepatitis A virus; ssPHK(+); семейство Picornaviridae), вируса гепатита В (Hepatitis В virus; dsflHK-RT; сем. Hepadnaviridae), вируса гепатита С (Hepatitis С virus; ssRNA(+); сем. Flaviviridae), вируса-сателлита гепатита D (Hepatitis delta virus; кольцевая ssPHK; вне семейства), вируса гепатита Е (Hepatitis Е virus; ssRNA(-t-); сем. Hepeviridae). В заключение раздела следует отметить, что в современной классификации вирусов животных в первую очередь используются методы биоинформатики, оперирующей большими массивами генетических данных. При таком подходе не всегда учитывается фенотип, хотя именно он во многом определяет характер взаимоотношений вируса и хозяина. Известны случаи, когда вирусы, которые на основе результатов генетического анализа классифицируются как высокопатогенные, оказывались слабопатогенными, и наоборот. Примером служат разные варианты вируса подтипа H5N1 гриппа птиц, изолированные из полевого материала при вспышке «птичьего» гриппа в 2005-2008 гг.