Трансляция геномной РНК

Трансляция геномной РНК начинается с образования капсомеров, поскольку их старт-кодоны наиболее доступны; при этом изменяется вторичная структура мРНК и на короткое время открывается старт-кодон одной из субъединиц репликазы. Репликация. Несколько репликазных комплексов инициирует синтез РНК(-) на плюс-нитях, что позволяет ограничить размер ds-интермедиатов, которые иначе могли бы стать мишенью для хозяйских РНКаз. Затем с РНК(-) считываются новые копии вирусного генома. При прохождении репликазы по РНК(-) на вновь синтезируемой РНК(+) обнажается старт-кодон гена белка А. Преимущественное накопление РНК(+) обеспечивается тем, что минус-интермедиат всегда доступен для репликазы, в то время как плюс-нить связывается и с рибосомами, и с белками капсида. Помимо своей основной функции (формирование капсида) структурные белки регулируют переход от репликации к сборке: они связываются с мРНК в области старт-кодона гена репликазы, что блокирует ее образование. Сборка. Как у всех представителей семейства Leviviridae, сборка частиц фага MS2 определяется взаимодействием капсидных белков со шпилечной структурой в геномной РНК. Высокая специфичность этого взаимодействия находит применение в препаративной биохимии при очистке РНК-белковых комплексов, а также в молекулярной биологии для выяснения локализации и оценки интенсивности транскрипции. Любой ген, лигированный с нетранслируемым участком РНК бактериофага MS2, в котором содержится рас-сайт, будет связываться с капсидным белком; в свою очередь, после трансформации бактерий плазмидой, содержащей гибридный ген капсидного белка и флуоресцирующего белка GFP, можно установить момент накопления мРНК, а также определить зону их преимущественной локализации. Выход частиц. Зрелые частицы высвобождаются в результате деградации клеточной стенки под воздействием белка-лизина, который блокирует УДФ-N — ацетилглюкозамин-1-карбоксивинилтрансферазу (MurA), что приводит к прекращению полимеризации мономеров муреина. Синтез белка лизиса, ген которого перекрывается с геном капсидного белка и с геном репликазы, регулируется изменениями вторичной структуры мРНК, что предотвращает преждевременный лизис.