Вирусы археи

Еще недавно вирусов архей считали экзотическими объектами, не интересными «обычной» вирусологии. Однако в последнее время внимание к ним повысилось; число посвященных им публикаций неуклонно растет, что объясняется тремя основными причинами. Во-первых, большинство вирусов архей, как и их хозяев, существует на границе адаптационных возможностей органической жизни, что относится к области интересов таких молодых и быстро развивающихся наук, как экстремальная биология и экзобиология. Во-вторых, с этими вирусами связывается перспектива обнаружения новых механизмов репликации и экспрессии генов. В-третьих, не принимая во внимание этих вирусов, мы не сможем реконструировать раннюю эволюцию органической жизни. Вирусы архей интересны и в прикладном плане. Те из них, которые относятся к числу умеренных, могут служить векторами для осуществления гетерологичной экспрессии генов белков. В то же время литические вирусы архей опасны для производственных систем, где их хозяева используются в качестве продуцентов.

Согласно результатам оценки сходства нуклеотидных последовательностей 16S рДНК филогенетическое древо домена Archaea состоит из четырех фил. Две из них, фила Euryarchaeota («вездесущие» архей) и фила Crenarchaeota («архей из горячих источников»), включают в себя большинство изученных видов архей. Две другие филы, Korarchaeota («юные» архей) и Nanoarchaeota («карликовые» архей), бедны представителями и преимущественно содержат виртуальные объекты, не охарактеризованные в фенотипическом плане.

К филе Euryarchaeota принадлежат облигатные экстремальные галофилы (класс Halobacteria), облигатные метаногены (классы Methanobacteria, Methanococci и Metha — nopyri), облигатные термоацидофилы (класс 7Hermoplasmata) и серозависимые экстремальные термофилы/гипертермофилы (классы Thermococci и Archaeoglobi). К филе Crenarchaeota преимущественно относятся экстремальные термофилы/ гипертермофилы (класс Thermoprotei), большинство из которых растет при температуре >80°С. В порядки Thermoproteales и Desulfurococcales входят (ан)аэробы/ней — трофилы или факультативные анаэробы, восстанавливающие серу, в порядок Sulfolo — bales — окисляющие серу ацидофилы-аэробы или факультативные анаэробы.