Вирусы бактерий названы бактериофагами

Как уже отмечалось, вирусы бактерий названы бактериофагами из-за драматичного (литического) финала одного из альтернативных сценариев онтогенеза, и этот термин используется в литературе независимо от типа инфекции. Действительно, помимо литической инфекции, широко распространены лизогенные и псевдолизо — генные инфекции, причем один и тот же бактериофаг может выбирать свой путь развития. В то же время хронические инфекции вызывают только представители семейства Inoviridae. Что касается персистентных вирусных инфекций, то они у бактерий неизвестны. У всех групп бактерий имеются собственные вирусы, среди которых наиболее изучены фаги бактерий кишечной группы (Е. coli и S. typhi серовар Typhimurium).

В настоящее время известно 12 семейств бактериофагов; в основном это dsflHK — бактериофаги. Бактериофаги с геномной РНК более редки, а РНК(-)-бактериофаги вообще не обнаружены. Геном бактериофагов имеет размер 4-600 тыс. п. н. Большинство морфологического разнообразия бактериофагов (до 90%) — это безоболочные вирусы со сложным типом симметрии, состоящие из головки и (не)сократимого хвостового отростка. Оболочные бактериофаги относятся к семействам Cystoviridae и Plasmaviridae. Эти бактериофаги — самые разнообразные и многочисленные; они заражают представителей большинства актуалистических фил бактерий. Именно они в свое время стали модельными объектами при изучении молекулярных основ наследственности; это для них были оптимизированы и стандартизированы методы поддержания и культивирования бактериофагов. В настоящее время бвДИК-бактериофагов объединяют в 6 семейств; мы рассмотрим только те, представители которых обладают линейной dsJ(HK и сложно устроенными вирионами (семейства Myoviridae, Podoviridae, Siphoviridae и Tectiviridae). У членов семейств Myoviridae, Podoviridae и Siphoviridae вирионы снабжены хвостовым отростком с дополнительными придатками. На основе сходства морфологии они объединены в порядок Caudovirales («хвостатые» бактериофаги). Однако единство этих семейств и родов внутри них спорно. Геномы этих бактериофагов почти не обнаруживают взаимного сходства, они «мозаичные», т. е. являются комбинацией фрагментов вирусных и хозяйских генофоров. В данном случае построение филогенетических систем даже по сходству последовательностей нескольких генов не отражает истинных эволюционных связей.