Геномная ДНК
Геномная ДНК упаковывается через портал — специализированный канал на одной из вершин икосаэдра, образованный белком UL6. Его строение недавно изучено с помощью метода криоэлектронной томографии; выяснилось, что он имеет вид конической втулки с 12 зубцами. Внутри капсида геномная ДНК образует тороидальную структуру, которая отчетливо выявляется на ультратонких срезах. Поскольку герпесвирусы не имеют гистоноподобных ДНК-связывающих белков, компактизация ДНК достигается в ходе упаковки в результате образования комплекса с полиаминами (спермином и спермидином). Строение генома. Геномная ДНК вируса HHV-1 (рис. 81) состоит из двух ковалентно связанных сегментов — длинного и короткого, которые обозначаются, как Ul (сокр. англ, unique long; 126 тыс. п. н.) и Us (сокр. англ, unique short; 26 тыс. п. н.); они фланкированы инвертированными повторами Ab и Ь а (в сегменте Ul) и ас и С’а’ (в сегменте Us). Поскольку эти сегменты могут принимать разную ориентацию, в популяции вируса всегда присутствуют четыре изомера с их разным взаимным расположением. На обоих З’-концах геномной dsflHK находятся неспаренные основания («липкие концы»), с помощью которых она замыкается в кольцо при попадании в клеточное ядро.
Геном герпесвируса HHV-1 кодирует около 85 белков, гены которых подразделяются на три блока: самые ранние (англ, immediate early, а), ранние (англ, early, /3) и поздние (англ, late, у).
Самые ранние a-гены обеспечивают избегание иммунного ответа на начальном этапе инфекции и регулируют транскрипцию /3-генов. Важнейшими из продуктов трансляции /3-генов являются ДНК-полимераза и тимидинкиназа, а также ряд других белков, ответственных за метаболизм и репликацию ДНК. Поздние у-гены кодируют белки капсида и тегумента. В повторах а и а локализованы сигналы упаковки Pad И Рас2. Цикл репродукции.