Структурные различия между генами psbA хозяина и вируса
Структурные различия между генами PsbA хозяина и вируса позволили сконструировать таксоноспецифичные праймеры, которые используются в PCR-реакции в режиме реального времени для выявления экспрессии генов цианофага P-SSP7 по ходу его репродукции в клетках Р. marinus. Установлено, что в середине цикла копий — ность транскриптов вирусного гена PsbA превышает таковую генов хозяина и что параллельно с этим растет число копий вирусного белка D1. Вероятно, вирусные гены PsbA служат фактором эволюции прохлорококков, повышая их адаптационный потенциал в изменяющихся условиях окружающей среды.
Помимо генов фотосинтетического аппарата в геноме вирусов прохлорококков содержатся гены, продукты которых участвуют в метаболизме углерода и фосфора. В частности, это гены семейства MipB/talC, которые кодируют трансальдолазу — один из ключевых ферментов окислительного пентозофосфатного цикла. Судя по реконструированной аминокислотной последовательности продуктов этих генов, они могут быть функционально активными и участвовать в метаболизме инфицированных клеток. Прохлорококки обитают в олиготрофной зоне Мирового океана с низким содержанием фосфатов, и неудивительно, что в геномах миовирусов присутствует прокариотный ген PhoH, который, в частности, индуцируется у Е. coli при фосфорном стрессе. По данным биоинформатики он принадлежит к обширному семейству генов с разнообразными функциями, среди которых можно назвать метаболизм фосфолипидов, посттрансляционный процессинг РНК, /?-окисление жирных кислот и т. д. Второй ген фосфорного метаболизма — PstS кодирует периплазматиче — ский связывающий белок, участвующий в импорте фосфатов. Вероятно, в инфицированной клетке продукт экспрессии вирусного гена PstS может выполнять аналогичную функцию. У фага P-SSP7, инфицирующего Р. marinus MED4, имеется ген сайтснецифичной рекомбиназы (int), которая обеспечивает интеграцию вирусной ДНК в хромосому хозяина, хотя для других фагов Т7-группы характерен литический путь инфекции. Этот фаг был выделен из поверхностного слоя морской воды на исходе периода летней стратификации, когда истощается пул минеральных элементов. В таких условиях интеграция в хозяйскую хромосому для фага, несомненно, выгодна. Хотя в настоящее время отсутствуют данные об индукции умеренных бактериофагов в культурах пресноводных и морских цианобактерий, полевые наблюдения на штаммах Synechococcus sp. косвенно свидетельствуют о такой возможности.