Гены вирусов кренархеотов

Гены вирусов кренархеотов (за исключением тех, которые отвечают за гликози — лирование структурных белков, репликацию ДНК, рекомбинацию, интеграцию и метаболизм нуклеотидов) не удается аннотировать, так как неизвестна их функция. Несходство генов и белков с генами и белками, функция которых известна, не позволяет детально изучить онтогенез этих вирусов. Реконструкции онтогенеза вирусов архей, в целом, и вирусов кренархеотов, в частности, может способствовать анализ паттерна экспрессии генов (транскрип — тома) в ходе их репродукции, а также анализ влияния на него транскрипционных факторов клетки-хозяина. Хозяевами вирусов кренархеотов выступают (ан)аэробные представители порядка Sulfolobales: Acidianus, Pyrobaculum, Sulfolobus и Thermoproteus, а также Автору — rum pernix — аэробный представитель порядка Desulfurococcales. Они заселяют материковые, островные, морские и океанические гидротермы (60-90°С; pH 1-9), широко распространенные в обоих полушариях. Архей Acidianus и Sulfolobus являются аэробами/экстремальными ацидофилами (рН<2), в то время как Pyrobaculum и Sulfolobus Принадежат к числу анаэробов/нейтрофилов, a A. pernix — к облигатно аэробным нейтрофилам. Природные гидротермы, в частности горячие источники с температурой выше 80°С, служат экологической нишей для высокоадаптированных экстремально термофильных и гипертермофильных микроорганизмов, многие из которых обладают уникальными генетическими свойствами и ранее были неизвестны. В последнее время в геотермальных экосистемах открыты вирусы, большинство которых, в отличие от банальных хвостатых фагов эвриархеотов, имеет беспрецедентную морфологию (каплевидные, веретеновидные с моно — или биполярными отростками, бутылевидные, икосаэдрические с башнеобразными выростами). Помимо нетривиальной морфологии (рис. 53) эти вирусы обладают рядом необычных молекулярных признаков, что позволило обособить восемь новых семейств: Из них четыре семейства — Fuselloviridae, Guttaviridae, Lipothrixviridae и Rudiviridae — одобрены Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), поэтому их названия приводятся без кавычек. Еще четыре вируса (TTV-4, STIV, STIV2 и STSV1) не отнесены ни к одному из вирусных семейств и рассматриваются обособленно.