Лизогения или лизогенная фазовая инфекция

Лизогения (англ, lysogeny), или лизогенная фазовая инфекция, характеризуется отсутствием стадий сборки капсида и упаковки ДНК, хотя вирус потенциально способен перейти к литическому сценарию. Приобретение лизогенного состояния называется Лизогенизацией (англ, lysogenization). При лизогении геном бактериофага встраивается в хозяйскую хромосому. Этот процесс называется Интеграцией (англ, integration) и осуществляется с помощью вирусной Интегразы (англ, integrase). Геномная ДНК бактериофага, встроенная в хромосому и образующая с ней единый репликон, называется Профагом (англ, prophage; Букв. — предшественник фага). В свою очередь, бактерия, в хромосому которой встроен профаг, называется Лизогенной (англ, lysogen bacterium).

Бактериофаги, способные вызвать лизогению, называются Умеренными (англ, temperate phage), в отличие от Вирулентных, или литических, бактериофагов (англ, virulent phage, lytic phage), размножение которых чаще всего приводит к лизису клетки-хозяина. Лизогенная инфекция приобретает либо хронический характер, либо временный. Во втором случае происходит Индукция профага; он удаляется из клеточной хромосомы и начинает размножаться по литическому сценарию. Индукция профага, как правило, связана с воздействием агентов, повреждающих ДНК, или иных стрессовых факторов. Переходу к литической инфекции может способствовать вирус-хелпер. В частности, умеренные фаги Р2 и Р4 выступают в качестве взаимных дерепрессоров. Фаг Р4 дерепрессирует профага Р2 за счет белка Е, который взаимодействует с репрессором С; в результате последний отсоединяется от промотора, что активирует транскрипцию генов поздних белков. В свою очередь, фаг Р2 дерепрессирует профага Р4 с помощью белка Сох, активирующего промотор генов репликации.

Известны бактериофаги, которые способны выбирать тот или иной путь развития инфекции. В частности, это фаг лямбда (сем. Siphoviridae см. раздел 2.7.1.3), инфицирующий Е. coli. На примере интеграции и эксцизии этого бактериофага был впервые изучен механизм сайтспецифичной рекомбинации.