Галерея
10226 10775 10933 11397 11485 11822 12520 12693
Интересные записи
Топовое
Случайное

Распространение R/M-систем

Распространение R/M-системРаспространение R/M-систем ограничено миром прокариотов, главным образом бактериями. Аналогичные системы существуют у архей (например, Mwol — система типа II Methanobacterium wolfei), хотя они более редки и изучены намного хуже, чем у бактерий. «Автометилирующие» метилтрансферазы типа II (см. ниже) закодированы в геномах ряда вирулентных и умеренных бактериофагов, а также, в виде исключения, представлены у вирулентных вирусов Chlorella sp. Но даже в случае бактерий они выявлены только у 25% изученных штаммов, что может объясняться упущениями при анализе. Зато половина этих штаммов обладает сразу несколькими R/M-системами. Селективная выгода, которую дают бактериям разные R/M-системы, обусловливает их широкое распространение и разнообразие (>3 тыс. вариантов). В настоящее время описано несколько типов R/M-систем, которые выполняют одну и ту же биологическую функцию, но разными способами. Их особенности касаются субъединичного состава, используемых кофакторов, а также структуры сайта узнавания и местоположения сайта рестрикции (табл. 8). Для обозначения R/M-систем используются трехбуквенные сокращения названия их обладателя; первая буква обозначает род, вторая и третья вид; иногда за ними следует индекс штамма, а римская цифра указывает на тип системы (например, EcoRII — это R/M-система Е. coli штамма R, тип II). Гены, кодирующие компоненты R/M-систем, обозначаются либо как Hsd (сокр. от англ, host-specifity of DNA), либо по конкретной субъединице, например, Mod (сокр. от англ, modification). Они входят в состав хромосомного генома (например, в случае системы ЕсоА), плазмидного генома (например, в случае системы EcoRl) или вирусного генома (например, в случае системы ЕсоР) и часто сцеплены.

R/M-системы типа I. Системы данного типа имеются у энтеробактерий Citrobacter sp„ Е. coli и Salmonella sp. Они наиболее сложны и состоят из трех субъединиц: R (135 кДа; ген HsdR) — рестрицирующей; М (62 кДа; ген HsdM) — модифицирующей и S (55 кДа; ген HsdS) — обеспечивающей специфическое распознавание сайта метилирования. Комплекс субъединиц, представленных в разном стехиометрическом соотношении (например, 2:2:1 в случае ЕсоК), является мультифункциональным ферментом, играющим роль рестриктазы, метилазы, АТФазы и ДНК-топоизомеразы.