Современная систематика вирусов

Согласно решению ICTV в систематике вирусов используются четыре основных таксона: порядок, семейство, род и вид. В некоторых случаях вводится промежуточный таксон — подсемейство. Этим таксонам официально присваиваются латинские, греческие или латинизированные имена, которые оканчиваются, соответственно, на -virales, — viridae, — virineae и -virus. Они пишутся с заглавной буквы курсивом. Выше уровня порядка вирусы официально не классифицируются, несмотря на ряд авторитетных предложений применить к ним категорию класса (classis), а также такую глобальную категорию, как царство (regnum). На момент написания учебника (2010-2011) своим решением ICTV формально признавал шесть порядков вирусов. Порядок Caudovirales (от лат. cauda — хвост; у представителей данного порядка вирионы обладают хвостовым отростком) объединяет семейства Myoviridae, Podo — viridae и Siphoviridae. Порядок Herpesvirales (от греч. herpeton — пресмыкающееся; в частности, к трем подсемействам семейства Herpersviridae, типового семейства данного порядка, принадлежат вирусы герпеса человека) объединяет семейства Alloherpesviridae, Herpesviridae и Malacoherpesviridae. Порядок Mononegavirales (от греч. monos — один и лат. negativus — отрицательный; представители данного порядка содержат ssPHK(-)) объединяет семейства Вог — naviridae, Filoviridae, Paramyxoviridae и Rhabdoviridae. Порядок Nidovirales (от лат. nidus — гнездо; у представителей данного порядка в геномной ssPHK(+) нуклеотидные последовательности, используемые в качестве мРНК, сгруппированы и образуют «гнездо») объединяет семейства Arteriviridae, Сого — naviridae и Roniviridae. Порядок Picomavirales (от итал. piccolo — маленький и RNA; представители типового семейства Picornaviridae образуют относительно небольшие, около 25 нм, вирионы и содержат ssPHK(+)) объединяет семейства Caliciviridae, Dicistroviridae, IJla — viridae, Marnaviridae, Picornaviridae, Potyviridae и Secoviridae. Порядок Tymovirales (сокр. англ, turnip yellow mosaic; представитель типового семейства вызывает желтую мозаику турнепса) содержит семейства Alfaflexiviridae, Betaflexiviridae, Gammaflexiviridae и Tymoviridae. Во всех перечисленных случаях очевидно взаимное родство вирусов, проявляемое на таксономическом уровне выше семейства.