Вид у прокариотов

Согласно консенсусной формулировке, вид у прокариотов — это совокупность генетически родственных и фенотипически сходных популяций, клонально размножающихся в разных природных местообитаниях и лабораторных культурах. Мера внутреннего родства и сходства для представителей вида оговаривается отдельно, также на консенсусной основе. Вирусологи долго противились использованию категории вида применительно к своим объектам, аргументируя это тем, что на вирусов, которые размножаются клональным способом, не распространяется классическая концепция биологического вида (хотя видовой критерий репродуктивной изоляции не применяется и в случае прокариотов). Основной довод в пользу использования категории вида в таксономии вирусов состоит в том, что это живые существа, которые имеют реплицирующиеся гены, эволюционируют и адаптируются к экологической нише. Но в то же время это неклеточные живые существа, функционально не активные вне живой клетки, молекулярные паразиты. В 1991 г. ICTV пришел к выводу о необходимости сформулировать определение вида у вирусов и добавить эту таксономическую единицу к роду, подсемейству, семейству и порядку (которые уже использовались при их классификации).

Формальное определение, вошедшее в ICTV (Правило 11), гласит: Вид у вирусов — Это группа штаммов, полученных из разных источников, или ряд штаммов, полученных из отдельного источника, которые имеют общий набор стабильных свойств, обособляющих ее от другой группы штаммов. Напомним, что термином «штамм» (англ, strain), или «изолят» (англ, isolate), обозначается популяция микроба, ставшая объектом хранения или исследования в результате однократного выделения из природного материала.