Галерея
10226 10775 10933 11397 11485 11822 12520 12693
Интересные записи
Топовое
Случайное

Одинаково расположенные участки двух геномов

Одинаково расположенные участки двух геномовОдинаково расположенные (выровненные) участки двух геномов могут иметь идентичную последовательность, хотя встречаются совершенно разные последовательности, а также участки с низким уровнем взаимного сходства. Они имеют собственную эволюционную историю, которая сводится к серии горизонтальных обменов. Такие участки называются «модулями» (англ, module); считается, что каждый из них кодирует минимальную функциональную единицу — домен белковой молекулы, белок или группу сопряженно функционирующих белков. При горизонтальном обмене модули имеют возможность закрепиться в геноме, поскольку новый хозяин приобретает функцию, которая может быть поддержана естественным отбором. В результате обмена модулями возникают химерные гены и геномы; в частности, химерную природу имеют геномы всех бактериофагов. Реконструировать филогенетическую связь между ними — почти невыполнимая задача. Например, считающиеся родственными фаг лямбда и фаг НК97 имеют практически идентичные гены белков хвостового отростка, однако совершенно разные гены структурных белков головки вириона. В геномах многих бактериофагов очень трудно выявить протяженные участки взаимного сходства; еще труднее обнаружить сходство между генами бактериофагов и генами ДНК-содержащих вирусов эукариотов. Зато геном любого бактериофага имеет собственный, зачастую уникальный набор генов, которые не встречаются в базах данных и, естественно, не аннотируются. Такие гены называются Орфанами (англ, orfan; Игра слов — ORF, сокр. open reading frame — открытая рамка считывания, и orphan — сирота). Интересно, что орфаны, как правило, экспрессируются и, следовательно, они нужны вирусам для выполнения каких-то функций. Скорее всего, они кодируют вспомогательные белки, играющие роль квазишаперонов. При связывании с белками клетки-хозяина они модифицируют их структуру с целью оптимального взаимодействия с главными вирусными белками.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *