Инициирующий комплекс состоит из ДНК-полимеразы

Инициирующий комплекс состоит из ДНК-полимеразы AdVPol (140 кДа), белка рТР (75 кДа), белка ТР (55 кДа) и ДНК-связывающего белка DBP, а также ядерных белков NFI и NFIII (сокр. англ, nuclear factor). В отличие от клеточных ДНК-полимераз, затравкой для которых служит гидроксильная группа РНК-праймера, аденовирусная AdVPol использует гидроксил остатка Ser-588 в полипептидной цепи белка рТР.

На первом этапе полимераза синтезирует тринуклеотид CAT, который комплементарен не только матричному триплету GTA (в положении 4-6), но и триплету GTA, расположенному слева от него на З’-конце. Затем инициирующий комплекс смещается в направлении З’-конца, в результате чего триплет CAT спаривается с оконечным триплетом GTA. На этом процесс инициации заканчивается; клеточные факторы NFI и NFIII диссоциируют от ДНК, и начинается элонгация. Полимераза AdPol отсоединяется от белка рТР и копирует ДНК в направлении 3′-»5′; при этом вытесняемая нить укрывается ДНК-связывающим белком DBP. Белок рТР на дочернем дуплексе расщепляется аденовирусной протеазой и превращается в белок ТР.

Возникает вопрос, какое преимущество дает аденовирусу такой механизм инициации репликации? По-видимому, благодаря началу копирования на внутреннем участке матрицы обеспечивается сохранение концов линейной ДНК. У некоторых бактериофагов (например, у фага PRD1; сем. Tectiviridae) имеет место аналогичная инициация с помощью белкового праймера; возможно, что аденовирус использует этот очень древний механизм. Вытесняемая нить ДНК постепенно освобождается и в конце концов образует дуплекс с комплементарной ей нитью или внутренний дуплекс в результате спаривания ITR. Спаренные ITR содержат на 5′-конце белок ТР, поэтому этот участок (panhandle; см. выше) может также использоваться для инициации синтеза ДНК по вышеописанному механизму.