ДвДНК-содержащие вирусы
В свою очередь, Параретровирусами (англ, pararetrovirus; от греч. рага — в стороне; в Данном случае — подобные ретровирусам называются ДвДНК-содержащие вирусы, репликативными интермедиатами которых служат ssPHK и ssflHK. В качестве примера назовем гепаднавирусов, допустим, вируса гепатита В человека (Hepatitis В virus) и колимовирусов, в частности, вируса мозаики цветной капусты (Cauliflower mosaic virus, CMV). Из-за разрывов, имеющихся в обеих комплементарных нитях, геномная ДНК параретровируса не могла бы реплицироваться с помощью собственной ДНК-полимеразы или хозяйской ДНК-полимеразы (которая к тому же отсутствует), что заставляет использовать обходную стратегию репликации генома. В данном случае геномная dsflHK, имеющая кольцевую форму, транскрибируется при помощи клеточной РНК-полимеразы II. Часть транскриптов представляет собой мРНК, которые транслируются в вирусные белки. Наряду с такими «частичными» транскриптами синтезируется молекула «прегеномной» вирусной РНК, размер которой превышает размер геномной вирусной ДНК. Этот транскрипт играет роль мРНК (в том числе для трансляции обратной транскриптазы), а также служит репликативным интермедиатом для синтеза новых кольцевых молекул геномной dsflHK путем обратной транскрипции. Дефектные вирусные геномы. Общая генетическая «дефектность» вирусов выражается в их неспособности репродуцироваться вне организма-хозяина.
Однако термин «дефектный вирус» используется не для глобального противопоставления неклеточной и клеточной форм жизни, а отражает генетическую неполноценность по сравнению с «недефектным» вирусом. Другими словами, имеется в виду ситуация, когда один или несколько генов, ответственных за образование полноценных вирионов, по той или иной причине теряют активность или отсутствуют.
От собственно дефектных вирусов следует отличать «условно-дефектных» мутантных вирусов (термочувствительные мутанты, мутанты по спектру хозяев и т. д.), которые проявляют свою дефектность только в непермиссивных условиях. Не относятся к разряду дефектных и «псевдовирионы» фагов (которые образуются при общей трансдукции, когда фрагмент хозяйской хромосомы полностью замещает геномную нуклеиновую кислоту).