Литический фиковирус из рода Coccolithovirus

Литический фиковирус из рода Coccolithovirus тоньше регулирует функции клетки-хозяина. В то время как другие фиковирусы не содержат генов, кодирующих РНК — полимеразу, и полностью полагаются на клеточный аппарат транскрипции, он обладает этим ферментом, что позволяет функционально не обременять ядро клетки. Лишь на протяжении первого часа после проникновения вируса некоторые его гены (в том числе ген РНК-полимеразы) транскрибируются за счет водоросли, а затем в дело вступает вирусная РНК-полимераза, и транскрипция основной части генов вируса передислоцируется в цитоплазму. Вирионы не скапливаются в клетке водоросли, а постепенно покидают ее; по-видимому, они используют тот же транспортный путь, который в норме обеспечивает секрецию кальцита. Водоросль все равно лизируется, однако это происходит позже, чем в системе PBCV-Chlorella, что продлевает срок инфекции и обеспечивает дополнительную сборку вирусных частиц. У представителей рода Phaeovirus в ходе инфекции геном интегрируется в хромосому хозяина. Иными словами, для их жизненного цикла характерна стадия лизогении. Вирусные частицы инфицируют свободно плавающие гаметы, лишенные клеточной стенки. Через 5 мин после прикрепления вириона к клеточной мембране гаметы вирусная ДНК доставляется в ядро, где с помощью вирусной интегразы встраивается в хромосому хозяина. При митозе все клетки развивающегося таллома получают копию вирусного генома, который не проявляет себя только в спорангиях и гаметангиях. При образовании репродуктивных органов запускается репликация вирусной ДНК, за которой следуют разрыв ядерной оболочки, сборка вирионов и их выход. В результате вирусные геномы наследуются по законам Менделя, а зрелые вирусные частицы обнаруживаются только в репродуктивных органах хозяина. Результаты мультилокусного молекулярно-филогенетического анализа указывают на то, что семейство Phycodrtaviridae монофилетично, и позволяют установить степень родства между его членами. Как оказалось, к общему предку фиковирусов ближе всего вирус EhV. В свою очередь, рода Phaeovirus и Chlorovirus обладают высоким уровнем внутригеномной рекомбинации и образуют общую ветвь на дендрограмме. В этом семействе есть единственный род Chrysovirus, который раньше относили к семейству Partitiviridae. Однако теперь установлено, что связь между хризовируса — ми и партитивирусами весьма отдаленная.