Род Leishmaniavirus

Геном этих вирусов имеет размер 5,3 тыс. п. н.; как и у других представителей семейства Totiviridae, он кодирует белок капсида и RdRP; а также содержит небольшую потенциальную ORF на 5-конце. Белок капсида обладает специфической эндорибонуклеазной активностью — он удаляет последовательность размером 320 нуклеотидов на 5-конце вирусной мРНК; вероятно, таким путем устраняется ингибирование трансляции. Вирусы рода Leishmaniavirus передаются при клеточном делении; инфекция, которую они вызывают, протекает бессимптомно. Род Totivirus. Тотивирусы, поражающие грибы, образуют частицы диаметром 40 нм; икосаэдрический капсид состоит из 120 капсомеров СР (сокр. от англ, capsid protein). Геномная нуклеиновая кислота представлена молекулой dsPHK размером 4,7-6,7 тыс. п. н. Наряду с ней в инфицированных клетках всегда присутствуют дефектные вирусные РНК, а иногда и сателлитная РНК. Геном содержит две ORF; первая (gag) кодирует белок СР, вторая (Pol) — RdRP. Они почти всегда перекрываются на участке 16-130 н. Геномная dsPHK никогда не покидает капсид и служит матрицей для синтеза мРНК, которая поступает в цитоплазму и там транслируется. Плюс-нить многократно реплицируется до заполнения капсида и только потом высвобождается в цитоплазму, где полноразмерные копии генома упаковываются в отдельные капсиды. После инкапсидирования синтезируется минус-нить РНК, в результате чего восстанавливается двунитевая структура генома. Трансляция, которая начинается с уникального сайта узнавания рибосомы, приводит к образованию главного белка СР (р78; 78 кДа). Помимо него из-за сдвига рамки считывания на один нуклеотид на участке GGGUUUA, где рибосома проскальзывает по матрице, синтезируется минорный белок RdRP (р88; 88 кДа).

Для сборки капсида важно обеспечить правильное количественное соотношение белков СР и RdRP, а для сборки вирионов необходимо перевести белок СР в фосфо — рилированную форму. Комплекс белков CP/RdRP взаимодействует с ssPHK(+), а затем CP-участок начинает полимеризоваться совместно с субъединицами «обычного» белка СР. Белок RdRP путем протеолитического расщепления превращается в белок СР; при этом он дефосфорилируется, и РНК высвобождается из вириона.